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Linux使用ODBC方式还是DBI方式安装R语言扩展包好?

  Linux系统用户在使用R语言连接SQL数据库时,需要安装其他的扩展包,那么我们该使用ODBC方式进行安装还是使用DBI方式进行安装呢?今天小编就给大家分析下这两种安装方式的区别吧。

Linux使用ODBC方式还是DBI方式安装R语言扩展包好?

  数据分析经常需要从外部获得数据。很多情况下数据存放在关系型数据库中。一般我们可以用SQL来提取需要的数据,存为文本再由R来读入。这种方式结合了数据库的储存能力和R的分析能力,速度也非常快。但是如果要形成一套可重复性的自动工作流程,则可以将R与外部数据库连接,直接在R中操作数据库,并生成最终结果,这也是一种可行的方法。

  在R中连接数据库需要安装其它的扩展包,根据连接方式不同我们有两种选择:一种是ODBC方式,需要安装RODBC包并安装ODBC驱动。另一种是DBI方式,可以根据已经安装的数据库类型来安装相应的驱动。因为后者保留了各数据库原本的特性,所以个人比较偏好用DBI连接方式。有下面这几种主要的包提供了DBI连接:RMySQL,RSQLite,ROracle,RPostgreSQL。由名字看得出它们分别对应了几种主流的数据库。

  这几种数据库中SQLite是一个轻量级的数据库,完全免费,使用方便,不需要安装,无须任何配置,也不需要管理员。如果只需要本地单机操作,用它来配合R来存取数据是非常方便的。下面来看看R中操作SQLite数据库的示例。

  从零开始:

  1、下载SQLite,它是一个单独的执行文件,并且是在命令行下操作。如果不习惯可以安装sqlitebrowser之类的GUI。先把它放到一个文件夹中,例如sqlite。

  2、在sqlite中执行sql脚本,建立一个数据库。将脚本文件放到同一个文件夹中,然后执行下面的。现在文件夹中应该有train.db这个数据库文件了。

  .read Scheme.sql

  .read Data.sql

  .backup train.db

  3、在R中安装RSQlite包

  install.packages(‘RSQlite’)

  4、加载RSQlite包,建立连接后用SQL读取数据

  library(RSQLite)

  # 建立连接,注意数据库类型和文件地址

  con 《- dbConnect(‘SQLite’, dbname=‘d:/sqlite/train.db’)

  # 观察数据库中有三个数据表格

  dbListTables(con)

  # 观察其中一个表的字段

  dbListFields(con, ‘Apply’)

  # 写一段SQL语句,来选取需要的数据

  sql 《- “select sName, GPA, decision ,cName

  from Student, Apply

  where Student.sID = Apply.sID

  and sizeHS 《 1000 and major = ‘CS’ and cName = ‘Stanford’”

  # 将选取的数据存入到data中,同时显示出来

  (data 《- dbGetQuery(con, sql))

  # 关闭数据库连接

  dbDisconnect(con)

  以上就是使用ODBC方式进行安装和使用DBI方式进行安装扩展包的区别了,有需要的用户可以看看这篇文章参考下。

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